灵宝市国土总面积3011平方公里（451.7万亩），其中山区面积1481平方公里，占国土总面积49.2%；丘岭面积1208平方公里，占国土总面积40.1%；平原面积322平方公里，占国土总面积10.7%。国土总面积中，耕地面积6.47万公顷（97万亩，农业局提供数字），林地（含果园）面积16.07万公顷（241万亩），滩涂和荒山荒坡面积7.3万公顷（110万亩）。

已探明的有金、银、铜、铅、锌等有色金属和石墨、硫铁、大理石、花岗岩、水晶石等非金属矿藏38种，尤以金、银、铜、铅、硫铁、大理石、花岗岩、石墨等为最。黄金年产20余万两，居全国县（市）级采金第二位，是国家确定的黄金生产基地。硫铁矿量大质优，已探明储量4892.1万吨，硫含量37%以上。

灵宝市境内河流属黄河水系。共有大小溪流6300多条，常年有水的天然地表河流1401条，主要有好阳河、弘农涧河、沙河、阳平河、枣香河、十二里河、双桥河等7条黄河一级支流，呈由南向北流向，直接注入黄河，流域面积3000多平方公里。建国以来，共建成大、中型水库各1座，小型Ⅰ类水库10座，小型Ⅱ类水库12座，平均地表水资源总量为4.8460亿立方米。2000年4月，河南省地质矿产厅环境水文地质总站，历时一年，对灵宝地下水资源进行了调查评价，经估算灵宝地下水总量为1.82亿立方米，过境水为0.3213亿立方米，重复量为0.2807亿立方米，加上地表经流，水资源总量为6.7066亿立方米。

灵宝市处于暖温带南沿，为南北植物成分交汇区，受土壤、气候及崤山、小秦岭高大山体的影响，形成了多种类型的生物群落，且呈明显的植被垂直分布带。据调查资料表明，高等植物约有144科，780属，2100种；木本植物有60科，141属，380种。珍稀树种有秦岭冷杉、领春木、连香树、水曲柳等，主要分布在小秦岭，属国家或河南省保护品种，在科学研究上有极其重要的价值。动物资源很丰富，现有国家一级保护野生动物5种，即豹、黑鹤、金雕、白肩雕、白尾海雕；国家二级保护野生动物35种，如穿山甲、豺、小灵猫、金猫、林麝、大鲵等；河南省级保护野生动物33种，如刺猬、小麂、大白鹭等。